云南省2008-2018年人间狂犬病流行特征及狂犬病病毒基因分析
Chinese Journal of Zoonoses(2021)
Abstract
目的 分析云南省2008-2018年人间狂犬病的流行特征,对近3年新获得的狂犬病病毒(rabies virus,RABV)进行基因特征分析.方法 运用描述流行病学方法分析2008-2018年人间狂犬病疫情资料;用直接免疫荧光法(Direct im-munofluorescence assay,DFA)检测2015-2018年人和其它动物脑组织样本,DFA阳性样本提取核酸和反转录,用特异性引物对组织标本中病毒的核蛋白(nucleoprotein,N)基因和糖蛋白(glycoprotein,G)基因进行逆转录聚合酶链式反应(Reverse Transcription-polymerase chain Reaction,RT-PCR)扩增,经序列测定后用分子生物学软件进行系统进化分析.结果 2008-2018年全省狂犬病发病死亡病例828例,全省发病率在0.046/10万~0.285/10万之间波动;11年来,全省狂犬病发病呈下降趋势,全年均有发生,夏秋季节高发;发病人群以农民为主,各年龄组均有发病;全省共16个州(市)中14个有病例报告,红河和文山等老疫区疫情仍较重,疫区面积不断扩大.对2015-2018年的46份DFA阳性的样本经RT-PCR扩增后获得N基因序列34个和G基因序列33个,系统进化分析结果提示34个RABV N基因和33个RABV G基因均属于YN-A进化群,并与来自四川省的6株RABV亲缘关系最为接近,34个N基因间核苷酸和氨基酸的同源性是99.2%~100%和99.1%~100%,33个G基因间核苷酸和氨基酸同源性是98.5%~100%和98.7%~100%.结论 云南省狂犬病持续流行,疫情呈下降趋势,疫区范围不断扩大,在重视老疫区疫情的同时应关注新疫区的疫情趋势;34个RABV N基因和33个RABV G基因分析结果均属于YN-A进化群,与中国Ⅰ型RABV处于同一分支,YN-A分支的RABV毒株为目前云南省的优势流行株.
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