转录因子FOXP2调控先天性巨结肠相关基因表达的生物信息学分析

目的 鉴定与肠神经系统发育以及先天性巨结肠(HSCR)发生相关的转录因子.方法 运用ChEA 3数据库对调控HSCR易感基因表达的转录因子进行预测以及富集分析,使用GeneMANIA在线工具构建转录因子与靶基因的蛋白-蛋白相互作用网络图,探讨其可能调控的分子通路,以Human Protein Atlas数据库对转录因子进行蛋白表达定位,探究其在神经系统和结肠的表达情况.采用实时荧光定量PCR方法,验证相关转录因子在30例HSCR患儿的狭窄段和扩张段肠管标本中的表达差异.结果 用ChEA 3数据库对已报道的119个HSCR易感基因的转录因子预测及富集分析发现,FOXP 2可以靶向作用于其中46个基因.在GeneMANIA数据库中分析显示FOXP 2可能调控多个HSCR易感基因的表达,与Hedgehog通路的GLI 3共表达,与PTCH 1存在遗传相互作用.Human Protein Atlas数据库分析显示,FOXP 2蛋白在脑神经元细胞和结肠组织中高表达.30例HSCR患儿中位年龄为1岁,其中男23例、女7例,荧光定量PCR结果显示,FOXP 2的mRNA表达量在病变组织较临近正常组织下降,差异有统计学意义(t=5.819,P<0.001).结论 FOXP 2可能通过调控Hedgehog信号通路,影响肠神经细胞发育过程,与HSCR的发病相关.