胃癌组织PBRM1基因缺失/突变的临床病理意义和分子改变

目的 探讨胃癌布罗莫结构域1(PBRM1)基因改变及其相关的临床病理特征和分子改变.方法 应用cBioPortal(258例)及LinkedOmics(393例)数据集统计分析PBRM1基因缺失/突变与胃癌临床病理参数、预后及分子改变的关系.收集2016-01-01-2016-12-31南京医科大学附属无锡人民医院233例胃癌组织通过免疫组化法进行初步统计验证.结果 公开数据库显示,胃癌中PBRM1缺失/突变占9.30％(24/258),其PBRM1 mRNA表达显著减少,LogFC=-0.538,P<0.001.PBRM1缺失/突变与富集分析的拷贝数(χ2=11.063)及甲基化(χ2=24.056)、CpG岛甲基化表型(CIMP)类别(χ2=23.635)、MLH1沉默(χ2=22.437)、微卫星稳定(MSI)状态(χ2=35.696)、分子亚型(χ2=38.125)、ARID1A突变(χ2=23.689)、超突变(χ2=31.404)以及PIK3CA突变(χ2=29.917)有显著关联性,均P<0.01.PBRM1 mRNA表达与其启动子甲基化呈显著负相关,Pearson相关系数=-0.359,P<0.001.PBRM1突变与免疫抑制分子细胞程序性死亡配体1(PDL1;CD274)及细胞毒性T淋巴细胞相关蛋白4(CTLA4)mRNA高表达显著相关,LogFC分别为0.898和0.683,均P<0.001.PBRM1基因突变患者预后较好,χ2=-0.501,P=0.231.病例收集验证部分显示,233例中34例(14.6％)PBRM1表达缺失,并与错配修复(MMR)蛋白丢失显著相关,χ2=8.592,P=0.003;与p53异常表达显著负相关,χ2=-4.414,P=0.036.PBRM1表达缺失患者预后显著较好,χ2=3.958,P=0.047.结论 PBRM1基因异常在一部分胃癌亚群中可能具有重要的致癌作用及预后意义,PBRM1基因异常检测及相关机制的应用可能成为胃癌的新型预后标志物及治疗策略.