基于生物信息学方法对胰腺癌血浆差异miRNA和基因表达的分析研究

目的 采用生物信息学方法进一步筛选和验证胰腺癌血浆标志物,为明确其分子机制提供依据.方法 通过关键词"胰腺癌、血浆、miRNA"进行检索,搜集文献,并下载原始数据,进行生物信息学分析,寻找具有特异性的血浆miRNA标志物,预测其靶基因,进行通路富集和互作分析,通过文献数据和数据库进行关键基因的验证,分析其差异表达谱及其与胰腺癌预后的关系.结果 通过对GSE59856和GSE124158进行差异miRNA的筛选,最后筛选得出miR-122-5 p.通过对miR-122-5 p预测得到了517个靶基因,并对靶基因作GO/KEGG富集分析.进一步对靶基因做蛋白互作图,并通过相关文献的查询与筛查,筛选出UBA52、AD-AM10、CBL、VAMP3这4个关键基因.根据TCGA表达谱及文献数据论证,与健康人相比,胰腺癌患者高表达UBA52、ADAM10、CBL、VAMP3.VAMP3、ADAM10基因低表达的胰腺癌患者总体生存率更高(P<0.05).结论 采用生物信息学方法对胰腺癌患者血浆差异miRNA进行分析,筛选出的miR-122-5 p具有作为胰腺癌诊断标志物的潜力.miR-122-5p作用的关键靶基因VAMP3、ADAM10与胰腺癌的预后密切相关.