基于生物信息学分析乳腺癌组织中Rspo3基因甲基化水平及临床意义

目的:讨论Rspo3基因在乳腺癌组织中的表达情况,启动子甲基化水平及意义.方法:通过The Hu-man Protein Atlas分析Rspo3蛋白在乳腺癌组织中的表达情况;利用Oncomine、GEPIA、UALCAN数据库分析Rspo3 DNA、mRNA在乳腺癌组织中的表达情况;利用MethHC和UALCAN数据库分析Rspo3基因启动子区域甲基化水平;利用String-DB分析与Rspo3相互作用的蛋白.结果:在蛋白水平上,Rspo3蛋白在乳腺癌组织中较正常乳腺组织低表达,在DNA、mRNA水平上,Rspo3在乳腺癌组织中较正常乳腺组织显著低表达,且其启动子甲基化水平则显著增高.与Rspo3相关蛋白有LGR(4～6)、UBA52、UBB、UBC、Rspo1、Rspo4、ZNRF3、RNF43,可能调节乳腺癌中Wnt/β-catenin信号传导通路的激活.结论:基于现有的肿瘤数据库进行生物信息学分析,可以发现Rspo3在乳腺癌组织中呈低表达,其启动子甲基化水平则表达增高.这为深入研究乳腺癌,并发现新的乳腺肿瘤标志物提供了大样本数据支持.