嫁接番茄长链非编码RNA(lncRNA)的鉴定

嫁接是重要的农业栽培措施之一,具有增加产量、提高抗性、改善品质等作用.目前对植物嫁接的分子机理研究已经拓展到RNA水平,但主要集中在mRNA和小RNA上,而对长链非编码RNA(lncRNA)的研究还不多见.本研究对公共数据库中嫁接番茄转录组数据进行分析,分别在接穗(番茄)和砧木(马铃薯)中鉴定出3 360和5 657个物种特异lncRNA,其中有298和847个lncRNA差异表达,9个lncRNA可在接穗和砧木间移动.进一步分析表明,lncRNA的移动机制与相对表达丰度没有明显关联,lncRNA具有调控嫁接植株代谢过程和花期的潜在作用.本研究结果为嫁接番茄lncRNA的鉴定和功能预测提供理论依据.