水稻植物激素响应低温胁迫反应的转录组分析
Molecular Plant Breeding(2021)
Abstract
植物激素在调节和控制植物生长发育、代谢过程、应对逆境等方面具有重要的作用.为明确水稻苗期植物激素对低温的应答机制,本研究以野生型粳稻品种'中花11'为研究材料,经低温处理后,利用RNA-Seq技术分析植物激素调控水稻幼苗对低温胁迫的应答模式.通过转录组测序,共获得9.9×107条干净的序列,筛选出2 044个差异表达基因(DEGs).首先,GO富集分析结果表明差异表达基因主要富集在生物学过程、细胞组分和分子功能三个方面.进一步的KEGG通路分析表明,差异表达基因主要富集在代谢途径、次生代谢生物合成、植物激素信号转导等途径.其中植物激素信号转导中低温应答的差异表达基因为31个,分别为25个上调表达基因和6个下调表达基因;主要参与了茉莉酸和脱落酸信号途径.这些研究结果对水稻苗期植物激素的低温应答机制完善和栽培调控具有重要的参考价值.
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