基于生物信息学分析急性心肌梗死合并慢性阻塞性肺疾病的关键基因和潜在药物

China Medical Herald(2021)

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摘要
目的 基于生物信息学分析急性心肌梗死(AMI)合并慢性阻塞性肺疾病(COPD)的关键基因和潜在药物,为疾病的诊断治疗提供新的生物信息学依据.方法 从GEO数据库下载了包含AMI和COPD微阵列信息的3个数据集并筛选差异表达基因(DEG).对两种疾病共有的差异表达基因进行了GO功能注释、KEGG通路富集分析、Metascape富集分析.然后构建了蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络识别参与疾病发生发展的关键基因.最后,本研究使用药物-药物基因相互作用数据库来寻找潜在的治疗药物.结果 通过对AMI和COPD的3个数据集整合后获得61个DEGs,GO功能注释结果显示其主要涉及炎症反应、碳水化合物和糖皮质激素受体结合.多位于细胞器外膜和颗粒内腔.KEGG、Metascape富集集中于免疫、炎症、凋亡等途径.PPI网络识别的8个关键基因,共筛选了74种可能相关的治疗药物.结核菌素、托马利拉单抗、白藜芦醇己酸、塔斯奎尼德、帕尼莫德与疾病的关联性高.结论 鉴定出的基因和通路可能是AMI合并COPD的潜在治疗靶点,为疾病分子机制提供新的依据.
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