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水芹治疗新型冠状病毒肺炎的网络药理学预测和分析

China Medical Herald(2021)

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Abstract
目的 运用网络药理学研究方法,预测和分析水芹防治新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的可能性和机制.方法 通过文献和TCMSP、Swiss Target Prediction数据库获得水芹中活性成分及其治疗COVID-19的潜在作用靶点;运用GeneCards、TTD、OMIM、Drugbank等数据库获得COVID-19相关靶点信息;采用Cytoscape构建"活性成分-靶点-疾病网络";使用STRING数据库结合Cytoscape构建蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络图;通过DAVID数据库和计算机R语言进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析.结果 选取水芹中7个活性成分,获取活性成分-疾病靶点60个,关键靶点为TNF、IL-6、MARK-1、CASP3等,KEGG富集分析发现潜在信号通路有TNF、Toll样受体和PI3K-Akt等信号通路;GO富集分析发现生物过程涉及炎症反应、细胞凋亡、免疫应答等;分子功能涉及蛋白质结合、酶结合、细胞因子活性等,细胞组成涉及细胞质、质膜、细胞核、线粒体等.结论 水芹活性成分可能通过TNF、Toll样受体信号通路影响病毒关键靶蛋白的表达,发挥抗感染、免疫调节、抗病毒等作用,本研究为水芹防治COVID-19的实验研究提供理论支持.
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