基于IDH突变相关代谢基因的胶质瘤分型探讨

目的 探讨异柠檬酸脱氢酶(IDH)突变相关代谢基因表达水平、胶质瘤分型.方法 采用加权相关网络分析方法对来自中国脑胶质瘤基因组图谱计划(CGGA)294例脑胶质瘤转录组数据进行分析,筛选与IDH状态(IDH突变型/野生型,IDH-mut/wt)相关差异表达基因(DEG).参照KEGG在DEG中筛选出代谢通路相关基因,对IDH-wt胶质瘤进行聚类分型.应用生存分析验证新分型的临床意义,应用随机森林分析筛选新分型的特征基因.结果 根据聚类结果将IDH-wt胶质瘤分为C1、C2和C3型.1年及3年生存率分析显示,IDH-mut和C1型胶质瘤患者生存率明显较C2及C3型患者高.应用随机森林分析筛选出C1型前5个最显著特征基因,分别为TK1、GPX8、RRM2、NNMT和GPX7,其MDG值分别为13.98、13.94、10.48、10.37和9.54.应用五基因模型诊断C1型,训练组(随机选择CGGA数据库中的2/3数据)的分类准确度为95.12％,灵敏度为93.75％,特异性为95.60％.结论 胶质瘤代谢亚型区分有助于准确判断预后,指导脑胶质瘤患者的个体化治疗.