治疗急性胰腺炎的大黄活性成分筛选及其靶基因生物学功能分析
Shandong Medical Journal(2021)
Abstract
目的 筛选治疗急性胰腺炎的大黄活性成分、活性成分靶基因,探讨靶基因的生物学功能及相关信号通路.方法 依托TCMSP数据库查询大黄所对应的靶基因,通过ADME参数(DL≥0.18,OB≥30%)筛选大黄可能的活性成分及其靶基因;然后,运用Genecards、OMIM、DRUGBANK等数据库获取急性胰腺炎的发病相关基因;并利用R语言将大黄活性成分靶基因与急性胰腺炎发病相关特异性基因交集,进而得到关键靶基因;通过Metascape平台进行关键靶基因生物学功能分析(GO注释和KEGG富集).结果 TCMSP数据库中检索到大黄活性成分共92个,通过ADME参数筛选到的活性成分主要包括β-谷甾醇、芦荟大黄素等,活性成分靶基因主要有NCOA2、PTGS2、PIK3CG、BCL2、BAX等.关键靶基因共包括CASP3、BAX、BCL2等30个,主要参与药物反应、凋亡信号通路、细胞增殖负调控等生物过程,膜筏、膜微域、膜域等重要的细胞组分,G蛋白偶联乙酰胆碱受体活性、G蛋白偶联胺受体活性、乙酰胆碱受体活性等分子功能;其富集在癌症、细胞凋亡、IL-17等多条信号通路上.结论 治疗急性胰腺炎的大黄活性成分主要包括β-谷甾醇、芦荟大黄素等,活性成分靶基因主要有NCOA2、PTGS2、PIK3CG、BCL2、BAX等;关键靶基因主要参与药物反应、凋亡信号通路、细胞增殖负调控等生物学过程,相关通路主要有癌症、细胞凋亡、IL-17等信号通路.
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