基于蛋白相互作用网络的帕金森病相关信号通路关键蛋白的筛选
Shandong Medical Journal(2021)
摘要
目的 通过构建帕金森病(PD)信号通路蛋白相互作用网络,探讨PD相关信号通路网络关键蛋白.方法 通过文献检索、信号通路数据库、STRING数据库及cytoscape软件,构建PD相关信号通路蛋白相互作用网络.利用cytoscape软件拓扑分析功能寻找信号通路相互作用网络中的关键蛋白.结果 共纳入9条PD信号通路,包括PI3K/AKT/mTOR通路、JNK通路、p38 MAPK通路、Wnt/β-catenin通路、Notch通路、SDF-1/CXCR4通路、NF-κB通路、JAK/STAT通路和Nrf2/ARE通路.构建信号通路蛋白相互作用网络后筛选出前10位关键信号蛋白,分别为AKT1、MAPK1、Jun、p53、c-MYC、JNK、TNF、PTEN、STAT3和mTOR.结论 成功构建了PD信号通路蛋白相互作用网络,筛选出与PD相关的信号通路蛋白,其中AKT1、MAPK1、Jun、p53、c-MYC、JNK、TNF、PTEN、STAT3、mTOR是PD信号通路蛋白相互作用网络中的关键蛋白,在PD发病过程具有重要作用.
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