Toll样受体基因组特征与直肠癌临床病理及免疫参数的相关性分析

目的 探讨Toll样受体家族成员对直肠癌发生、预后和免疫特征的影响,以及其基因调节区遗传变异与直肠癌发病风险的关系.方法 使用GEPIA平台分析Toll样受体3(TLR3)、TLR4、TLR5和TLR7在直肠癌中的表达及其与预后的关系.从TCGA数据库获取直肠癌mRNA转录组数据和临床资料,分析TLR3表达与病理分期的关系.使用PCR-RFLP技术对TLR4 rs1927914、rs7869402多态进行基因分型,使用TaqMan探针法对TLR3 rs5743303、TLR5 rs1640816、TLR7 rs7869402多态进行基因分型.应用非条件logistic回归分析TLRs遗传变异与直肠癌发病风险的关系.使用ESTIMATE对直肠癌样本的免疫细胞进行评分,通过TIMER在线数据平台分析TLR3表达及拷贝数变异(CNV)与免疫细胞浸润的关系.GO功能富集分析TLR3相关差异基因的表达,基因集变异分析(GSVA)预测直肠癌中TLR3的调控网络.结果 TLR3在直肠癌组织中呈低表达,且其低表达与预后不良有关.与TLR3 rs5743303 AA基因型相比,AT或TT基因型携带者的直肠癌发病风险明显升高(OR=1.43,95％CI 1.07～1.91).TLR4 rs1927914、TLR4 rs7869402、TLR5 rs1640816及TLR7 rs3853839多态不影响直肠癌的发病风险.分层分析结果显示,TLR3 rs5743303 AT或TT基因型可增加男性(OR=1.47,95％CI 1.01～2.11)、低年龄者(OR=1.64,95％CI 1.08～2.47)、吸烟者(OR=2.42,95％CI 1.37～4.38)和饮酒者(OR=2.70,95％CI 1.52～4.80)直肠癌的发病风险.ESTIMATE和TIMER分析结果显示,TLR3与免疫细胞浸润具有一定相关性.GO功能富集分析结果显示,TLR3主要与受体配体活性、抗原结合、免疫球蛋白受体结合、生长因子和细胞因子等相关功能的改变有关.GSVA分析结果显示,TLR3可通过调节细胞凋亡、自然杀伤细胞介导的细胞毒性、磷脂代谢及自噬调节等与代谢或免疫相关的途径而抑制直肠癌的发生发展.结论 TLR3与直肠癌的发生及预后相关,TLR3 rs5743303遗传变异可影响直肠癌的遗传易感性.