脂肪干细胞成骨分化的潜在关键基因与信号通路

目的 探讨脂肪干细胞(ADSCs)成骨分化过程相关的关键基因和信号通路.方法 从GEO数据库中下载GSE63754基因芯片数据,利用R语言的Limma软件包筛选出与ADSCs成骨分化过程相关的差异表达基因.针对差异表达基因构建蛋白质互相作用(PPI)网络和转录因子网络.通过cytoHubba插件筛选出与ADSCs成骨分化过程相关的潜在关键基因,采用R语言的clusterProfiler数据包对关键基因进行功能和通路富集分析.结果 共筛选出556个差异表达基因,其中228个基因上调,228个基因下调.PPI网络共包含314个基因,共预测5个转录因子(ESRP1、PRKAA2、POU5 F1 B、ATF4 HE和ZSCAN4).cytoHubba筛选结果显示,LEP、IL1 B、FGF2、CDH1、VEGFA、PPARG可能是ADSCs成骨分化过程相关的潜在关键基因;关键基因主要与p38丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)通路相关,并可能与成骨细胞分化相关.结论 LEP、IL1B、FGF2、CDH1、VEGFA、PPARG可能是ADSCs成骨分化过程相关的潜在关键基因,且p38 MAPK通路可能在这一过程中发挥重要作用.