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基于转录组的非洲菊PLC基因家族鉴定与进化分析

Chinese Journal of Tropical Crops(2021)

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Abstract
磷脂酶C(phospholipase C,PLC)广泛参与植物的生命活动和代谢过程,在抵御真菌感染的过程中发挥重要作用.本研究基于非洲菊转录组测序数据,鉴定出13个非洲菊PLC基因家族成员,其中NPC有3个,PI-PLC有10个.非洲菊PLC的蛋白序列长度在98~594 aa之间,蛋白理论分子量为11410.25~67998.85 kDa,等电点为4.74~9.59,均为不稳定亲水蛋白.亚细胞定位预测结果显示,13个成员分别定位于细胞壁、细胞膜、细胞质、叶绿体和细胞核中,表明不同成员功能上可能存在多样性.进化树分析表明,13个非洲菊PLC蛋白可分为2个亚组,进化关系较近的蛋白结构组成相似.非洲菊PLC家族成员在拟南芥中的同源蛋白PLC2、PLC4、AT2G40116可相互作用.非洲菊转录组的FPKM值分析表明,GjPLC2、GjPLC3、GjPLC8、GjPLC10在非洲菊中表达量高,感病植株中变化大,可能在抵御真菌感染过程中发挥重要作用.研究结果可为进一步研究非洲菊PLC基因的生物学功能提供依据.
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