烟草bZIP基因家族的鉴定及其在不同成熟度烟叶中的表达分析

Acta Tabacaria Sinica(2021)

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摘要
通过生物信息学方法,从普通烟草中共鉴定了 126个bZIP家族基因.基因结构分析表明:不同成员间外显子数目差异较大,最大达到13个,最少仅为1个.进化分析发现:126个NtbZIP基因被聚为11个亚族,同一亚族中的基因成员大多具有相似的外显子组成.bZIP结构域分析表明:家族成员的核心结构域非常保守,各成员都具有碱性区和亮氨酸拉链区.烟草与拟南芥bZIP基因系统进化分析显示:11个亚族中均存在烟草和拟南芥的bZIP成员,其中S分支所含的家族成员最多,共有43个成员.NtbZIP基因表达分析发现:大部分NtbZIP基因在不同成熟度烟叶中都有表达,但是不同成员的表达模式存在差异,其中NtbZIP84,NtbZIP115,NtbZIP119和NtbZIP120等基因表达量随成熟度提高而逐渐降低.
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