棉花转录因子GhSPL1生物信息学分析

为深入研究GhSPL1基因的功能,进一步探究SPL转录因子在植物生长发育过程中发挥的作用及其作用机制,利用生物信息学的手段,分析了棉花转录因子GhSPL1的基因结构和蛋白序列.生物信息学分析得到的结果是:GhSPL1蛋白质相对分子质量为109667.79 kDa,理论等电点(PI)是6.02,预测的总平均亲水性是-0.425,该蛋白的942 ～964位氨基酸为跨膜区,存在跨膜结构域.GhSPL1是一种具有亲水性的不稳定的酸性蛋白,没有信号肽,不是分泌型蛋白,不能在细胞中发生迁移;二级结构预测结果显示该蛋白主要是由α螺旋(30.09％)、延伸连(14.99％)、无规则卷曲(54.91％)构成;该蛋白三级建模得到的结果与二级结构预测的结果一致;GhSPL1基因在胚珠形成的第25天有较高的表达.综上所述,棉花中的转录因子GhSPL1在胚珠发育过程中发挥重要的调控作用,进一步研究棉花转录因子SPL在胚珠形成过程中的分子机制是挖掘功能基因的重要手段.