基于文本挖掘和生物信息学筛选放射性直肠炎的治疗药物

目的 利用网络数据库和文本挖掘与放射性直肠炎和伤口愈合相关的基因和分子途径,确定针对放射性直肠炎分子途径的药物选择.方法 通过文本挖掘确定放射性直肠炎和伤口愈合相关基因,选择两个基因集的交集,利用DAVID程序进行基因富集分析,使用STRING和Cytoscape进行蛋白质互作网络分析,在药物-基因相互作用数据库中查询富集的基因集,寻找放射性直肠炎的候选药物.结果 放射性直肠炎和伤口愈合有25个共有基因.GO分析发现这些基因参与细胞增殖调节、胚胎植入、凋亡调控等生物过程.KEGG分析显示这些基因介导移植物抗宿主病、TNF信号通路等信号通路.蛋白互作网络筛选出ALB、CDH1、IL1B、IL2、IL6、CXCL8、MMP2、MMP9、PLAU、TNF 10个关键基因.药物-基因互作分析发现36种药物成为放射性直肠炎的潜在药物.结论 发现的36种药物将为治疗放射性直肠炎药物提供新的思路,为研究新的靶标药理学提供更详实的理论基础.