利用生物信息学技术探究动脉粥样硬化斑块破裂的关键基因

目的 利用生物信息学技术探究动脉粥样硬化斑块破裂的关键基因.方法 对GEO数据库中的基因芯片进行检索筛选,获取GSE41571和GSE120521表达芯片,采用生物信息学工具和方法对芯片进行差异基因表达分析及功能分析.结果 获得96个差异表达基因,其中表达上调基因17个,表达下调基因79个.GO和KEGG分析发现,表达下调的差异基因功能主要富集在细胞黏附、细胞基质黏附、钙离子结合和钾离子跨膜转运等,通路主要富集在调节干细胞多能性的信号通路;上调的基因功能富集于免疫反应、血管内皮生长因子受体信号通路、细胞周期蛋白依赖性蛋白丝氨酸/苏氨酸激酶活性及蛋白质结合等.GSE41571芯片得到FZD7、ASPN、PAK3、STK38L、KIF3A、COL21A1、FAP、LCP2、HECW2、GLIS2,除LCP2上调外,其余基因在破溃斑块中均表达下调.GSE120521芯片中基因表达情况与GSE41571芯片结果一致.结论 LCP2可能为预测动脉粥样硬化斑块破裂和治疗提供新的分子靶点.