烟草TCTP基因克隆与生物信息学分析

翻译控制肿瘤蛋白(translational controlled tumor protein.TCTP)广泛分布在真核生物中,其表达在翻译和转录水平上受控制.近年来,在植物中对TCTP研究集中在植物生长与抗逆性方面.该试验以PVY高感品种"NC95"和高抗品种"SY04-3"为材料,克隆TCTP基因,并进行生物信息学以及相对表达量分析.结果表明:从"SY04-3"和"NC95"中分离出来的TCTP基因均包含507 bp的ORF,二者基因序列存在7处碱基突变,但均编码168个氨基酸,氨基酸序列存在1个区别.通过生物信息学分析显示,"SY04-3"和"NC95"分子量分别是18782.16和18773.06 kD,等电点分别是4.33和4.25.通过对氨基酸分析发现,TCTP蛋白为非跨膜亲水性蛋白,无信号肽,可能定位在细胞质,属于TCTP家族蛋白,"SY04-3"和"NC95"分别有13个和14个磷酸化位点,二者均有1个糖基化位点,进化分析显示与辣椒和茄子的亲缘关系最近.