鲢腐败希瓦氏菌株的16S rRNA鉴定

从患病鲢(Hypophthalmichthys molitrix)体表分离获得1株革兰氏阴性细菌,菌株编号为BD1-5,通过细菌形态学观察、革兰氏染色镜检、16S rRNA序列分析以及构建系统发育树分析等进行鉴定研究.结果表明,患病白鲢体表皮肤溃烂,尤其尾部溃烂严重;对该病例主要组织进行镜检未见明显寄生虫;分子生物学检测结果显示鲤春病毒血症病毒(Spring viremia of carp virus,SVCV)、鲤疱疹病毒II型(Cyprinid herpesvirusⅡ,CyHV-II)和锦鲤疱疹病毒(Koi herpesvirus,KHV)均为阴性;采用PCR方法获得该分离菌株16S rRNA序列片段大小为1416 bp,与Shewanella putrefaciens(GenBank NO.:KX185698)序列相似性为99.72％;构建系统发育树分析显示,该菌株与Shewanella putrefaciens(GenBank NO.:KY817253)等自然聚为一枝.综合菌株形态及16S rRNA序列分析,最终推测该分离株为腐败希瓦氏菌(S.putrefaciens),属于革兰氏阴性杆菌.研究结果为证明腐败希瓦氏菌(S.putrefaciens)是鲢养殖过程中一种潜在致病源提供理论依据和参考.