威宁鸡GnRH1、GnRH2基因SNPs鉴定及其与蛋品质性状的关联研究

为系统挖掘鸡促性腺激素释放激素1(Gonadotropin Releasing Hormone1,GnRH1)、促性腺激素释放激素2(Gonadotropin Releasing Hormone2,GnRH2)基因多态性位点,探析GnRH1、GnRH2基因变异对鸡蛋品质性状的遗传效应,本实验以威宁鸡为素材,采用直接测序技术对GnRH1、GnRH2基因单核苷酸多态性(SNPs)进行鉴定并分析.结果表明:威宁鸡GnRH1基因并未发现SNPs突变位点;GnRH2基因SNPs位点分别为外显子1的g.11 G>C错义突变,精氨酸变为脯氨酸,内含子1的g.237 T>C突变和g.259 T>C突变,内含子2的g.1191 A>G突变,内含子4的g.3535 G>T突变;外显子6的g.4090 T>C错义突变,苯丙氨酸变为丝氨酸;6个突变位点中g.4090 T>C位点为低度多态,其余均为中度多态;SNPS位点卡方(χ2)结果显示,g.1191 A>G和g.3535 G>T位点偏离Hardy-Weinberg平衡(P<0.05).关联性分析结果表明,g.259 T>C位点和g.1191 A>G位点分别对威宁鸡的蛋壳厚度、蛋壳强度影响达到显著水平,两位点的TT基因型有利于改善蛋壳厚度,AG基因型有利于改善蛋壳强度.因此,GnRH2基因g.259 T>C位点和g.1191 A>G位点有望作为威宁鸡蛋品质性状相关的关键位点和分子标记.