松辽黑猪OAS1基因多态性及其殖性状的关联分析

为探究寡腺苷酸合成酶1(oligoadenylate synthase 1,OAS1)基因多态性与松辽黑猪繁殖性状的关联性,试验选取130头松辽黑猪母猪为研究对象,利用Sanger直接测序法测序查找OAS1基因外显子1～8的SNP位点,使用SPSS 19.0软件分析OAS1基因SNP位点与松辽黑猪繁殖性状的关联性.结果 显示,在松辽黑猪OAS1基因外显子2、3和6上共检测到33个突变位点;其中在外显子2的110 bp处存在1个SNP位点(G110C),存在3种基因型:GG、GC和CC;在外显子3的176 bp处存在1个SNP位点(C176T),存在3种基因型:CC、CT和TT;在外显子6的145 bp处存在1个SNP位点(C145T),存在3种基因型:CC、CA和AA;在166 bp处存在1个SNP位点(G166A),存在3种基因型:GG、GA和AA;在206 bp处存在1个SNP位点(A206G),存在3种基因型:AA、AG和GG.卡方适合性检验结果显示,松辽黑猪OAS1基因G110C突变位点符合Hardy-Weinberg平衡状态,C176T、C145A、G166A和G206A位点均偏离Hardy-Weinberg平衡状态.群体遗传参数分析结果显示,各SNPs位点遗传杂合度均位于中等水平,为中度多态(0.25＜ PIC＜0.5).关联分析结果发现,G110C位点GC基因型个体总产仔数、产活仔数和断奶仔猪数均显著高于GG基因型个体(P＜0.05);C176T位点CT基因型个体断奶仔猪数显著高于CC基因型个体(P＜0.05);C145T位点CC基因型个体总产仔数和产活仔数均显著高于AA基因型个体(P＜0.05);G166A位点GA基因型个体断奶仔猪数显著高于GG基因型个体(P＜0.05);A206G位点GG基因型个体总产仔数和产活仔数显著高于AA基因型个体(P＜0.05).结果 表明,OAS1基因外显子区存在突变位点,对松辽黑猪部分繁殖性状有显著性影响.