济南市犬瘟热病毒H基因遗传进化分析

Progress in Veterinary Medicine(2021)

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摘要
为了解济南市犬瘟热病毒(CDV)的流行情况,通过随机采集7份济南市2019年1月-6月份宠物医院疑似感染CDV的临床样品,提取病毒RNA,扩增CDV H基因全长序列,连接至载体,测序后进行H基因序列的氨基酸及核苷酸同源性分析、进化树分析、主要氨基酸位点突变分析以及H基因抗原表位预测分析.结果显示,7个野毒株均为Asia-I型,H基因核苷酸同源性为98.7%?99.9%,氨基酸同源性为98.7%?100%,与疫苗株相比差异较大,核苷酸、氨基酸同源性分别为90.0%?90.9%和88.8%?91.4%.主要氨基酸位点突变分析表明,除SD-07为8个潜在天冬酰胺糖基化位点,其余6株均为9个潜在天冬酰胺糖基化位点.H基因抗原性预测分析表明,7个野毒株与疫苗株相比存在明显的差异.研究结果表明,济南市犬瘟热病毒株以Asia-Ⅰ型为主,野毒株同源性与疫苗株相比差异较大,不同毒株间存在遗传多样性.
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