2008年-2015年我国猪繁殖与呼吸综合征病毒分离株遗传进化分析

对2008年-2015年分离的56个PRRSV毒株进行全基因测序和序列比对,并对主要易变区Nsp2、GP5和非编码区进行分析.全基因分析结果显示,56个PRRSV均为美洲型PRRSV,其中54个毒株为高致病性PRRSV变异株,另外2个为类NADC30 PRRSV.54个高致病性PRRSV变异株之间的同源性为95.2％ ～99.9％,与高致病性PRRSV变异株代表毒株JXA1的同源性为97.2％ ～99.3％.2个类NADC30分离株之间的同源性为99.9％,与NADC30 PRRSV代表毒株NADC30的同源性为95.4％.主要易变基因分析结果显示,非结构蛋白Nsp2和结构蛋白GP5仍在不断变异中.54个PRRSV变异毒株中有48个PRRSV变异株在非结构蛋白Nsp2发生30aa的不连续缺失,此外有6个高致病性PRRSV变异株在N sp2区域还发生了其他缺失(其中1株多缺失12个核苷酸,1株多缺失19个核苷酸,2株多缺失29个核苷酸,1株多缺失48个核苷酸,1株多缺失120个核苷酸).2个类NADC30 PRRSV非结构蛋白Nsp2存在131个核苷酸的不连续缺失.大部分分离株在重要结构蛋白G P5发生aa突变,尤其是糖基化位点的位置和数量发生了不同程度的变化.