山西省部分地区猪圆环病毒2型基因遗传变异分析

为了解山西省猪圆环病毒2型(PCV2)基因的遗传变异情况,用特异性引物对山西省部分地区PCV2疑似病猪的病料进行了PCV2基因扩增,利用DNAStar和MEGA-X对PCV2全基因和ORF2基因进行遗传变异分析,并对ORF2基因推导的Cap蛋白进行变异分析.结果表明,获得6株完整的PCV2基因序列,基因全长1767 bp左右;6株PCV2全基因和ORF2基因之间核苷酸同源性分别为96.6％～99.9％和94.8％～99.9％,与GenBank上已发布的国内外参考毒株全基因间和ORF2基因间同源性分别为94.6％～99.8％和91.5％～99.9％.6株PCV2毒株ORF2基因推导的Cap蛋白氨基酸之间同源性为94.0％～100％,与GenBank上已发布的国内外参考毒株同源性为88.0％～100％.在鉴定测序的6株PCV2中,1株属于PCV 2d型,5株属于PCV 2b型,推断目前山西省PCV2流行毒株以PCV 2b型为主.