AaMcm1基因调控链格孢菌丝生长的转录组初步分析
Shandong Agricultural Sciences（2021）
Abstract
MADS box转录因子是生物体中重要的结合型转录因子,属于SRF型的Mcm1基因已被证实在多种真菌中发挥重要作用.本课题组前期对链格孢菌中的AaMcm1基因进行敲除,得到了生长速度严重下降的突变体,通过对该突变体及野生菌进行转录组研究,发现有1917个基因表达上调,1322个基因表达下调,GO分析表明上调基因参与了4057个生物学过程,主要为细胞过程、代谢过程、生物调节、生物过程调节和应激反应,下调基因参与了2825个生物学过程,主要为细胞过程、代谢过程、生物调节、定位和定位的建立.KEGG通路分析表明共有429个上调差异表达基因参与了191条信号通路,参与较多的信号通路包括真核生物核糖体合成、嘌呤代谢、细胞周期-酵母、核苷酸切除修复、DNA复制等;207个下调差异表达基因富集到170条信号通路中,主要包括碳代谢,淀粉和蔗糖代谢,甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸的代谢,酪氨酸代谢等.进一步分析发现三羧酸循环及氨基酸代谢途径中大量基因表达下调,推测这可能是突变体生长严重变慢的原因.对AaMcm1进行结合位点分析,以期能够找到该基因的靶基因,从而深入理解其调控机制.
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