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毛头鬼伞漆酶基因的预测及其生物信息学分析

梁倩倩, 牛鑫,宋利茹,魏生龙,柴倩囡,单华佳,席亚丽,陈艳霞,柯善文,冯九海

Jiangsu Agricultural Sciences（2021）

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Abstract
毛头鬼伞培养液具有较强的漆酶活性,漆酶在基质中木质素的降解和子实体的发育中发挥着重要作用.目前,人们已经完成毛头鬼伞基因组的测序,且数据已经释放至公共数据库中,但并未注释.为了掌握毛头鬼伞中漆酶的基因数量及其特征,基于已报道的毛头鬼伞漆酶蛋白的氨基酸序列,通过同源预测的方法从其基因组上预测获得21 个漆酶基因,并采用 ProtParam、SignalP 5.0、Sompa、TMHMM 2.0、SWISS-MODEL 和 WoLF PSORT 等生物信息学工具对其中20个相应漆酶蛋白进行预测,分析其基本理化特性、信号肽、二级结构、跨膜结构、三级结构和亚细胞定位等.研究结果可为毛头鬼伞漆酶基因的克隆及分子作用机制等研究提供参考.
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