烟草烟碱相关miRNA筛选及验证

为挖掘烟草中可能参与烟碱调控相关的miRNA,利用生物信息学方法,进行了烟草全基因组水平的miRNA鉴定,筛选出烟碱相关的miRNA,并利用qPCR和GC-MS技术对相关过表达miRNA材料开展了功能验证.结果显示,利用红花大金元3个时期5个不同组织(根、茎、叶、花和腋芽)共39个样品的miRNA测序数据,共鉴定出了2925个miRNA,其中1245个miRNA是已知的,包括43个烟草中已经报道的miRNA.过表达miR2635的材料靶基因NtQPT2表达量下降约48％～67％,过表达miRNA203材料的靶基因NtMATE1表达量下降达98％,两种过表达材料中平均烟碱含量分别降低了约69％和62％,表明miRNA2635和miRNA203可分别通过降低靶基因NtQPT2和NtMATE1的表达量进而降低烟草中的烟碱含量.