小麦WOX转录因子基因的全基因组鉴定与分析
Acta Laser Biology Sinica(2021)
Abstract
小麦是全球主要粮食作物之一.本研究运用生物信息学技术手段对普通小麦(Triticum aestivum L.)的WOX基因进行了全基因组鉴定、系统发育树构建、序列分析.结果显示:小麦基因组一共包含了26个WOX基因,其中在Phytozome数据库中收录有序列信息的有20个,可分为3个亚族,各亚族内的WOX基因具有相似的基因结构,内含子相位为0或1;该家族基因的蛋白质基序Motif 1、Motif 2、Motif 5和Motif 9较为保守,其中Motif 1和Motif 2推测为核心基序;该家族基因启动子包含ABRE、CAT-box、CGTCA-motif、RY-element等元件,说明小麦WOX基因可能参与调控胚乳或种子的发育,或参与分生组织的形成;TaWOX6、TaWOX8、TaWOX10可能参与小麦穗和茎秆的发育过程;TaWOX15、TaWOX18、TaWOX20在小麦胚乳中的表达量非常高,而在别的部位的表达量几乎为零,说明这3个基因与小麦胚乳的形成发育密切相关.该研究结果为进一步探讨小麦WOX基因的功能与分子作用机理奠定了基础.
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