基于网络药理学和分子对接技术探讨黄芩-黄柏药对治疗银屑病的有效成分及作用机制

Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica(2021)

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摘要
运用网络药理学及分子对接技术,探讨黄芩-黄柏药对治疗银屑病的有效成分及作用机制.首先通过检索文献和TCMSP数据库,搜集黄芩、黄柏中的化学成分,利用PharmMapper和UniProt数据库预测药物的作用靶点,通过OMIM、TTD、PharmGkb、DrugBank等数据库检索银屑病相关靶点,再借助Cytoscape软件分别构建"化学成分-作用靶点"网络、"银屑病靶点"网络和"化学成分-银屑病靶点"网络,使用Metascape数据库进行基因功能注释和通路富集分析,最后,利用AutoDock Vina软件将网络中度值较高的化学成分与核心治疗靶点进行分子对接.分析结果显示,网络中含有黄芩苷、汉黄芩苷、小檗碱、黄柏碱等88个化合物和30个靶点,主要涉及中性粒细胞介导的免疫[neutrophil mediated immunity(GO:0002446)]、T细胞激活[T cell activation(GO:0042110)]等免疫学生物过程和细胞色素P450对异种生物的代谢[metabolism of xenobiotics by cyto-chrome P450(hsa00980)]、细胞凋亡[apoptosis (hsa04210)]、磷脂酰肌醇3激酶(PI3K)/蛋白激酶B(Akt)[PI3K-Akt signaling pathway(hsa04151)]等信号通路.分子对接结果显示,主要活性成分与靶点均能自发结合,其中46个成分与EGFR蛋白对接结合能小于-8 kcal·mo1-1,蛋白蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)分析推测表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)蛋白可能是治疗银屑病的关键靶点,黄芩苷、小檗碱等活性成分与EGFR蛋白均具有较高的结合亲和力.该研究初步揭示了黄芩-黄柏药对治疗银屑病的多成分-多靶点-多通路作用机制,为该药对治疗银屑病的机制研究提供理论依据.
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关键词
Phellodendri Chinensis Cortex,Scutellariae Radix,molecular docking,network pharmacology,psoriasis
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