基于网络药理学和分子对接分析厚朴治疗消化性溃疡的作用机制

Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica(2021)

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摘要
厚朴具有治疗消化性溃疡(peptic ulcer disease,PUD)的作用,但其作用机制仍未阐明.该研究利用网络药理学方法及分子对接技术预测厚朴治疗PUD的作用机制.通过查阅文献和中药药理学系统分析平台(TCMSP)筛选得到15种厚朴治疗PUD的主要活性成分,利用SwissTargetPrediction数据库预测成分的潜在靶点,用Therapeutic Target Database (TTD)、Drug-Bank、Human Phenotype Ontology(HPO)数据库筛选疾病相关靶点,二者取交集,得到49个潜在作用靶点.利用STRING数据库筛选出置信度最高(得分>0.700)的靶点并通过Cytoscape 3.6.1软件建立蛋白-蛋白互作网络图.利用DAVID数据库对潜在靶点进行GO(gene ontology)富集分析及KEGG(Kyoto encyclopedia of genes and genomes)通路分析.GO富集分析发现,厚朴作用途径大多与核受体活性、配体激活的转录因子活性、G蛋白偶联的乙酰胆碱受体活性等有关.KEGG富集分析发现,厚朴可调节物质代谢、内分泌系统,通过调节p53信号通路、过氧化物酶体增殖物激活受体(peroxisome proliferator activated-recep-tor,PPAR)信号通路等来发挥作用.通过分子对接技术验证了15种成分与关键靶标(CHRM1、CHRM2、FABP1、mTOR、STAT3)均具有较好的结合活性.该研究表明,厚朴可通过参与细胞代谢,抑制炎症细胞因子,以及调控细胞增殖和凋亡发挥治疗PUD的作用.
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关键词
Magnoliae Officinalis Cortex,PPAR-γ signaling pathway,molecular docking,network pharmacology,p53 signaling pathway,peptic ulcer disease
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