结肠癌淋巴结转移的风险基因及列线图预测模型的构建

Cancer Research on Prevention and Treatment(2020)

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摘要
目的 寻找结肠癌淋巴结转移的相关风险基因,并构建由基因组成的列线图(nomogram)预测模型.方法 从TCGA和GEO数据库下载基因测序数据,利用差异分析和LASSO回归方法筛选基因.利用赤池信息准则确定最优的nomogram模型,ROC曲线、校准曲线及拟合优度检验评估模型预测的准确性,决策曲线分析评估临床应用价值.结果 通过筛选得到11个有效预测结肠癌淋巴结转移的基因.由年龄、病理T分期、TH、CDH4、PNMA6A、TNNC1、KIR2DL4、STUM、SFTA2构成的nomogram模型具有最小的AIC值(440.4).内部评估模型AUC值为0.800,外部验证AUC值为0.664,校准度及拟合优度均较佳.临床决策曲线分析法评估基于nomogram模型的风险判断可以带来临床获益.结论 共筛选出11个结肠癌淋巴结转移的风险基因.构建的nomogram预测模型的一致性和区分度良好,可帮助评估患者淋巴结转移状态.
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