Signatures mutationnelles des carcinomes épidermoïdes cutanés survenant chez les patients atteints d’épidermolyse bulleuse dystrophique récessive

Introduction L’epidermolyse bulleuse dystrophique recessive (EBDR) est une maladie cutanee hereditaire due a des mutations perte de fonction du gene COL7A1 codant le collagene de type 7. Les patients EBDR presentent une fragilite de la peau et des muqueuses responsable de bulles et erosions multiples et parfois diffuses entrainant des complications locales et systemiques dont la plus grave est le developpement de carcinomes epidermoides cutanes (CEC), premiere cause de deces de ces patients. Materiel et methodes Il s’agit d’une etude prospective observationnelle mono-centrique incluant des patients EBDR adultes operes a partir de 2016 dans notre centre de reference. L’objectif principal de notre etude etait de caracteriser les signatures moleculaires des CEC survenant chez ces patients. L’objectif secondaire est de comparer ces signatures moleculaires en fonction du caractere agressif ou non des tumeurs (criteres clinico-histologiques recommandations SFD 2009). Les echantillons provenaient de pieces operatoires, extraites dans le cadre du traitement chirurgical habituel de ces tumeurs. Nous avons analyse l’ADN de ces tumeurs par sequencage nouvelle generation (NGS) a l’aide d’un panel de 383 genes impliques dans les cancers epitheliaux. L’ADN a ete extrait de biopsies de peau tumorale et non-tumorale, afin d’exclure les variations germinales. Les mutations deleteres et les signatures mutationnelles ont ete analysees a l’aide du logiciel « Polyquery » et le package R « DeconstructSig » respectivement. Resultats Notre cohorte comprenait 18 patients dont les donnees epidemiologiques sont regroupees dans un tableau. Les analyses genomiques ont ete realisees a partir de 20 CEC chez 11 patients. Nous avons trouve des signatures mutationnelles liees aux expositions aux UV (signature 7) et APOBEC (signature 2) precedemment rapportees dans la litterature. Nous avons par ailleurs identifie 53 genes porteurs de mutations deleteres recurrentes ou une variation du nombre de copies. Les genes mutes sont notamment impliques dans les voies de signalisation du cycle cellulaire, du systeme immunitaire, la transcription des genes, et des voies des serine/threonine kinases. Nous avons identifie 27 autres genes porteurs de variations deleteres trouvees specifiquement dans les tumeurs de 2 patients decedes rapidement de CEC metastasiques. Certaines de ces mutations pourraient alterer des voies de signalisation impliquees dans la transition epithelio-mesenchymateuse. Discussion L’approche NGS basee sur notre panel de 383 genes lies au cancer a permis d’identifier differentes alterations moleculaires dans les CEC EBDR, dont certaines sont associees a une agressivite tumorale. Ces resultats pourraient ameliorer la comprehension des voies physiopathologiques impliquees et identifier des cibles therapeutiques dans les CEC survenant chez les patients EBDR.