MALDI-TOF MS Mikrobiyoloji Laboratuvarında Anaerop Tanımlamalarını Artırdı mı? Bir Üniversite Hastanesi Deneyimi

Amaç: Bu çalışmada, anaerop kültür istemi ile gelen çeşitli klinik örneklerde tanımlanan tür sayılarının Matriks destekli lazer desorpsiyonu/iyonizasyon süresi-kütle spektrometresi [matriks assisted lazer desorption/ ionization time of flight, mass spectrometry (MALDI-TOF MS)] ile birlikte nasıl bir değişim gösterdiğinin incelenmesi amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntemler: Çalışmaya, 2015-2018 yılları arasında Sivas Cumhuriyet Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesi Mikrobiyoloji Laboratuvarına çeşitli poliklinik ve servislerden anaerop kültür istemi ile gönderilen 419 farklı klinik örnek ve Clostridioides difficile istemiyle gönderilmiş 183 gaita olmak üzere toplam 602 örnek dâhil edilmiştir. Belirtilen yıllar içerisindeki anaerop kültür istemlerinin sonuçları BD EpiCenter' (Becton Dickinson, ABD) veri analiz sisteminden geriye dönük olarak incelenmiştir. Çalışmada MALDI-TOF MS ölçümleri, Bruker Microflex' LT model MALDI-TOF MS cihazı ve flexControl 3.0 yazılımı (Bruker Daltonics, ABD) kullanılarak yapılmış, tiplendirme için MALDI Biotyper® 3.0 yazılımı ve veri bankası kullanılmıştır. Bulgular: İncelenen farklı klinik materyallerden gönderilen 419 örneğin anaerop kültürlerinde MALDI-TOF MS yöntemiyle, 46 farklı anaerop bakteri türü tanımlanırken, gaita örneklerinde 10 farklı anaerop bakteri tür düzeyinde tanımlanmıştır. Tanımlanan anaerop bakteri izolatları içerisinde en yaygın cins %26,4 ile Prevotella iken, onu sırasıyla %17,6 ile Cutibacterium acnes, %12 ile Bacteroides ve %8,8 ile Fusobacterium cinsi üyeleri takip etmiştir. C. difficile istemiyle gelen 183 gaita örneğinde ise Clostridium perfringens (%47,3) en sık tanımlanan tür olarak tespit edilmiştir. Sonuç: Çalışmamızın sonuçları konvansiyonel yöntemlerle yapılmış çalışma verileri ile karşılaştırıldığında, anaerobik bakteri tanımlamalarında MALDI-TOF MS ile birlikte artış olduğu görülmüştür. MALDI-TOF MS sisteminin anaerobik bakteri tanımlamalarına önemli katkı sunabileceğini düşünmekteyiz.