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貂熊线粒体tRNA基因序列 及其二级结构预测

张士芳,魏丹,郭媛,朱世兵,李海军

Territory & Natural Resources Study（2018）

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Abstract
貂熊属环北型动物,列入国家Ⅰ级重点保护动物.本文利用PCR扩增、 测序和拼接获得了貂熊线粒体基因组全序列,其基因组全长16575bp,包括13种蛋白质,22种tRNA和2种rRNA和1个控制区.通过软件t RNAScan-SE1-21和RNA structure5.6对22种tRNA的二级结构进行预测,结果显示22种tRNA除tRNA-lys外均能折叠成典型的三叶草结构,碱基错配情况在氨基酸臂和DHU臂出现较多,而TψC臂和反密码子臂错配较少,共出现的35处错配,而其中25处为GU错配.碱基配对大部分符合Wasten-Click互补配对原则,少部分符合G-U摆动配对原则.
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