分子对接研究壬基酚与N-乙酰氨基葡萄糖苷酶的相互作用

目的:为了探究对壬基酚(p-NP)、邻壬基酚(o-NP)和间壬基酚(m-NP)三种异构体与N-乙酰氨基葡萄糖苷酶相互作用机制.方法:利用Autodock-tools 1.5.6和OpenBabel软件对NAGase和壬基酚的构象进行处理,再用Autodock vina软件进行分子对接,用PyMol和Discovery Studio 4.1分析两者对接的结合能量、结合方式和相互作用力.结果:模拟对接显示NAGase和壬基酚的三种异构体结合的能量分别为-5.7、-5.9、-5.9 kcal/mol;p-NP和NAGase通过疏水作用力结合,对接位点在NAGaseB链的Trp306、Trp373和His169;o-NP和NAGase通过氢键和疏水作用力结合,对接位点在NAGase A链的Val592和Leu595,还有B链的Ala140、Pro132和Tyr136;m-NP和NAGase也通过氢键和疏水作用力结合,对接位点在NAGaseB链的Tyr121、Trp306和Trp373.结论:壬基酚三种异构体和NAGase的相互作用机制有所差异.