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中国小反刍兽疫病毒M基因序列分析

Journal of Tarim University(2017)

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Abstract
为了分析中国PPR的流行特征,从Genbank数据库中下载PPRV M基因核苷酸全序列及其对应的氨基酸序列,应用DNAStar分子生物学软件对其进行遗传演化分析.结果显示,中国2013 ~2014年PPRV毒株间M基因核苷酸同源性范围为99.8%~100%,与西藏3个PPRV毒株M基因核苷酸同源性范围为97.9%~98.1%,与国外PPRV毒株M基因核苷酸同源性范围为89.5%~98.2%,即核苷酸同源性最高的为印度Sungri 1996 MSD株.中国2013 ~2014年PPRV毒株间M蛋白氨基酸同源性为100%,与西藏3个PPRV毒株M蛋白氨基酸同源性均为97%,与国外PPRV毒株M蛋白氨基酸同源性范围为96.7% ~ 100%.M基因核苷酸进化树分析显示,中国2013 ~2014年PPRV毒株与西藏的3个毒株不在同一分支,与印度毒株关系较近.推断中国2013 ~2014年PPR疫情非西藏2007年疫情的延续,可能为印度等周边国家传人.
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