应用16S rDNA克隆文库解析苏铁珊瑚状根内生放线菌种群多样性

苏铁为古老孑遗植物，被誉为“植物界的大熊猫”和“活化石”。为了研究苏铁珊瑚状根内生放线菌的多样性，通过16S rDNA克隆文库开展了珊瑚状根内生放线菌种群多样性研究，从16S rDNA克隆文库中随机挑选了164个克隆子进行序列测定，对测序结果进行了Blast对比，结果表明，苏铁珊瑚状根中放线菌多样性十分丰富，存在5个目7个科10个属，主要类群为短小杆菌属Curtobacterium、利夫森氏菌属Leifsonia、考克氏菌Kocuria、鸟氨酸微菌属Ornithinimicrobium、微球菌属Micrococcus、丙酸杆菌属Propionibacterium、链霉菌属Streptomyces、拟诺卡氏菌属 Nocardiopsis、芽球菌属Blastococcus；克隆得到的内生放线菌优势菌为短小杆菌属Curtobacterium，其次为拟诺卡氏菌属 Nocardiopsis和链霉菌属Streptomyces。其中68株内生放线菌是能分离培养的，经16S rDNA片段测序分析，结果表明这些内生放线菌分别与GenBank中已知属相似性达97%～100%；其余的序列相似性低于97%，表明苏铁珊瑚状根中可能存在着放线菌新种。