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贵州草海鲫鱼Spo11基因的克隆、生物信息学和表达分析

Ranran DONG, Xiuyun CHEN, Gangyi WANG, Changqian Lü

Journal of Chongqing Normal University(Natural Science Edition)(2018)

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Abstract
[目的]探索环境内分泌干扰物壬基酚(Nonylphenol,NP)对贵州草海鲫鱼(Carassius auratus)Spo11基因表达的影响.[方法]通过PCR方法克隆实验鱼Spo11基因,利用生物信息学方法分析SPO11蛋白的氨基酸序列、理化性质和结构特点;并设置1个对照组和低、中、高共3个不同剂量NP处理组,用NP质量浓度分别为0,25,50和100μg·L-1的水体浸浴实验鱼28d后,检测各组实验鱼Spo11基因的表达情况.[结果]Spo11基因cDNA序列长度为1 471bp(GenBank登录号:MF66470),包括66bp的5′非翻译区、编码383个氨基酸的1 152bp的开放阅读框和253bp的3′非翻译区.预测SPO11蛋白质相对分子质量为43.23kDa,等电点IP为6.89,主要由亮氨酸、丝氨酸和缬氨酸组成.该蛋白是含有信号肽的不稳性亲水蛋白,二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主.与对照组实验鱼的Spo11基因相对表达量相比,中剂量和高剂量的NP处理组实验鱼Spo11基因相对表达量均有所升高,与前者的差异均具有统计学意义(p<0.05).[结论]环境内分泌干扰物NP可以影响贵州草海鲫鱼Spo11基因的表达.
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crucian carp in Caohai lake of Guizhou Province,Spo11 gene,gene cloning,bioinformatics,nonylphenol
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