利用生物信息学发现SPINK1为结直肠癌MTX耐药潜在治疗靶点
Acta Scientiarum Naturalium Universitatis Nankaiensis(Natural Science Edition)（2020）
摘要
为筛选结直肠癌MTX耐药的潜在靶点,运用生物信息学手段从GEO(Gene expression omnibus)收集并整理有关结直肠癌甲氨蝶呤(MTX)耐药相关数据,利用GEO2R筛选对照细胞和耐药细胞表达差异的基因,并用细胞生物学手段验证该基因是否参与MTX耐药.结果显示15个基因在MTX耐药结直肠癌细胞中差异表达,其中13个上调,2个下调;其中表达差异最显著的是SPINK1.通过细胞增殖实验、细胞毒性实验证实敲低SPINK1抑制细胞增殖,解除结直肠癌甲氨蝶呤耐药性.该研究表明SPINK1可能是结直肠癌耐药潜在的治疗靶点.利用细胞生物学方法进一步确认其功能,可为进一步实验验证提供依据.
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