DNA 序列非退化的二维图形表示及其应用
Journal of Bohai University (Natural Science Edition)(2014)
摘要
提出了一种新的DNA序列的2-D图形表示方法,并证明了它的非退化性,随后结合图形表示给出DNA序列的12个正规化的ALE指标。在此基础上,结合双核苷酸计数和符号序列LZ复杂度,将DNA序列转化为一个29维的数值向量。对23个物种的β球蛋白基因和18个物种的线粒体NADH脱氢酶序列进行的系统发生分析,证明了所提方法的有效性。
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关键词
DNA,2-D graphical representation,nondegeneracy,ALE-index,phylogenetic analysis
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