不结球白菜耐热相关基因BcPLDγ的克隆和表达分析

Journal of Hubei University for Nationalities(Natural Sciences Edition)(2017)

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Abstract
以不结球白菜耐热自交系'高华青'、'苏州青'和热敏自交系'矮脚黄'为试验材料,利用RACE技术克隆得到不结球白菜BcPLDγ基因,利用生物信息学方法对该基因进行信息学分析,并采用qRT-PCR 技术对热胁迫处理条件下不结球白菜叶片BcPLDγ基因的表达模式进行了研究.结果显示,BcPLDγ基因的cDNA全长为2736bp,其中开放阅读框长度为1905bp,共编码634个氨基酸.该蛋白不存在信号肽序列,预测相对分子量为71.59kD,理论等电点为6.73.BcPLDγ蛋白的二级结构主要由α-螺旋、延伸直链、β-转角和无规则卷曲4种形式构成.该蛋白含有一个植物PLD特有的C2结构域和一个PLDc结构域.系统进化分析表明BcPLDγ蛋白与同属植物的进化关系相近,其中与甘蓝型油菜进化关系最近.热胁迫处理条件下,3份试验材料中BcPLDγ基因表达均显著上调,并于12h时达到峰值,且上调趋势与试验材料的耐热性呈正相关.
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