利用基因芯片技术筛选差异表达基因的方法研究
Mathematics in Practice and Theory（2017）
Abstract
为了探讨高维基因芯片基因表达谱数据筛选差异表达基因的方法,分析比较t检验法、秩和检验法、BON法、SIDAK法及ALSU法5种算法的差异表达基因筛选效率;采用模拟实验对t检验法、ALSU法等5种算法进行比较,并使用第一类、第二类错误率、总体错误率、筛选差异表达基因数及其均方根误差等5种指标进行评价;t检验法、秩和检验法计算结果过于灵敏,筛选差异表达基因个数较多,会促使筛选差异表达基因中假阴性事件的发生,BON法、SIDAK法筛选结果过于保守,筛选的差异表达基因个数较少,假阳性事件发生率较为显著,ALSU法能较稳定的抑制第一、二类错误率的发生,同时ALSU法筛选结果受系统扰动误差影响较笺LSU方法能够稳定的、高效的筛选差异表达基因,在使用高纬基因表达谱数据筛选差异表达基因时应首选ALSU法.
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Key words
Microarray gene expression data,differentially expressed genes,ALSU method,disturbance error model
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