HIV-1整合酶链转移抑制剂的3D-QSAR、分子对接和分子动力学模拟研究
Chemistry（2019）
Abstract
为了获得高活性、结构新颖的整合酶链转移(INST)抑制剂,本文采用CoMFA和CoMSIA两种方法对32个萘啶类INST抑制剂进行了三维定量构效关系研究,并建立了相关模型,其交叉验证系数分别为q2=0.809和q2=0.816,拟合验证系数分别为r2=0.998和r2=0.981,表明所建立的模型是可靠的且具有一定的预测能力.利用分子对接探讨小分子化合物与INST蛋白的相互作用模式,结果表明,萘啶类化合物主要通过疏水作用和氢键作用与INSTIs蛋白结合.最后通过分子动力学模拟进一步验证对接结果发现,对接的结合模式与分子动力学模拟得到的结果是一致的.本研究获得的综合模型和推论可以为开发有效的HIVINSTIs提供重要的理论信息.
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