环糊精与咖啡豆α-半乳糖苷酶的分子对接研究

Computers and Applied Chemistry(2015)

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摘要
通过分子对接方法研究3种主要的环糊精(α-环糊精、β-环糊精及γ-环糊精)与咖啡豆α-半乳糖苷酶的相互作用模型与分子机理.结果表明,咖啡豆α-半乳糖苷酶活性口袋中的关键氨基酸残基为:Trp31、Trp179、Asp200,环糊精中的关键基团为:次甲基上的羟基、亚甲基上的羟基.环糊精覆盖在咖啡豆α-半乳糖苷酶亲水活性空腔的表面,从而抑制其活性,β-环糊精的抑制作用较为明显.分子对接结果为酶法合成α-半乳糖基-环糊精的相互作用研究提供了理论依据.
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关键词
coffee-bean α-galactosidase,cyclodextrin,structure model,active site,molecular docking
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