广西药用野生稻遗传多样性分析及SSR引物数量对遗传多样性结果的影响研究

采用25对SSR分子标记,对广西境内采集的1610份药用野生稻材料进行遗传多样性和聚类分析,其中检测到等位变异181个,有效等位基因数Ae范围为1.0094 (RM240) ～2.2674 (RM488),平均值为1.3568;期望杂合度He范围为0.0093(RM240) ～0.5591 (RM448),平均值为0.2112;Shannon多样性指数1在0.0393～0.9296之间变动,平均值为0.3624.数据表明,广西药用野生稻遗传多样性较为丰富,12个药用野生稻地理居群按遗传多样性指数大小排序为:梧州-3＞南宁-1＞梧州-2＞梧州-1＞南宁-2＞玉林-2＞贵港-2＞梧州-4＞玉林-3＞玉林-1＞贺州＞贵港-1,其中指数高的居群均分布于梧州市和南宁市两地,因此确定了这两地为广西药用野生稻的遗传多样性中心.通过不同数量的SSR引物对药用野生稻材料间相似系数矩阵进行相关性测验,结果显示当引物按照PIC值降序排列时,10对引物即达到较好聚类效果,升序排列时,21对引物即达到较好聚类效果.研究表明,在进行药用野生稻大居群聚类分析时,SSR引物适宜数量应多于21对,最低不得少于10对.