小麦分蘖角度TaTAC1基因同源克隆及表达分析
Journal of Plant Genetic Resources(2017)
Abstract
分蘖角度影响植物群体结构、光合效率以及植株的形态建成,最终影响其产量及品质.小麦中关于分蘖角度的研究鲜有报道.前人研究显示,水稻OsTAC1正向调控分蘖角度的大小,玉米ZmTAC1与叶片角度呈正相关.本研究的目的是解析TaTAC1的表达模式并初步了解该基因的分子遗传机制及其与分蘖角度的遗传关系.本研究以CN16、SM969、Lan2399、SHW-1为材料,利用同源克隆分离获得TaTAC1,利用生物信息学软件对TaTAC1进行序列特征分析,应用实时荧光定量PCR对其表达模式进行分析,并进行TaTAC1蛋白的亚细胞定位分析.结果显示,TaTAC1长度约1.1~1.2 kb,包括780 bp的完整开放阅读框和320~370 bp的3′'-UTR.TaTAC1的cDNA序列分为2类,其中CN16-2、SM969-2的第10号碱基发生突变,引起终止子提前,导致TaTAC1表达受阻;Lan2399-2和SHW-1-2在109 ~115碱基位置有“CGCGCG”片段插入,导致蛋白质β-折叠片减少.表达分析表明,TaTAC1在分蘖期的叶鞘、茎高效表达,分蘖节其次,叶与根表达量最低.相关分析表明该基因在分蘖节各时期表达量与分蘖角度呈显著正相关,Pearson相关系数为0.677,其他组织表达量与分蘖角度无显著相关性.亚细胞定位分析显示TaTAC1定位于细胞膜.从上述结果可以推测TaTAC1在mRNA水平上正向调控分蘖角度,且可能参与生长素极性运输过程从而改变分蘖角度大小.
MoreKey words
expression analysis,TaTAC1,homology-based cloning,tillering angle,wheat (Triticum aestivum L.)
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