烟草BRANCHED1-Like基因的克隆及表达分析
Journal of Plant Genetic Resources(2015)
Abstract
TCP转录因子家族CYC/TB1簇中成员BRC1在调控植物侧枝发育的过程中发挥重要作用.本研究利用电子克隆结合RT-PCR方法从普通烟草(Nicotiana tabacum)中克隆获得4个NtBRCl-Like基因,分别命名为NtBRC1-Like1、NtBRC1-Like2、NtBRC1-Like3和NtBRC1-Like4.4条基因的CDS序列长度分别为1140 bp、1062 bp、987 bp和1041 bp,分别编码由379、353、328和346个氨基酸组成的蛋白,这4个蛋白与CYC/TB1簇中其他成员具有较高相似性.蛋白质保守结构域分析表明,4个NtBRC1-Like基因编码的蛋白除具有TCP核心结构域外,还具有CYC/TB1簇蛋白特有的R结构域.系统进化树分析表明,NtBRC1-Like蛋白都是TCP家族CYC/TB1簇中的成员,且4个NtBRC1-Like蛋白可以被分成2组,NtBRC1-Like1和NtBRC1-Like4为一组,NtBRC1-Like2和NtBRC1-Like3为另一组.荧光定量PCR分析发现,4个烟草NtBRC1-Like基因的表达呈现明显的组织特异性,且其表达模式可分为2种:NtBRC1-Like1和NtBRC1-Like4的表达模式相似,在腋芽中有极高的表达;NtBRC1-Like2和NtBRC1-Like3的表达模式十分相似,在叶和腋芽中的表达量都显著高于其他组织.推测烟草BRC1基因可能存在类似番茄BRC1基因在功能上保守与进化的情况.
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shoot branching,gene cloning,tobacco,BRC1 gene,gene expression analysis
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