基于数据挖掘分析ONECUT2基因在胃癌的表达及与幽门螺杆菌感染的相关性

目的 分析ONECUT2基因在胃癌中的表达及其与幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,H.pylori)感染的相关性.方法 (1)利用Oncomine数据库、TCGA数据库分析ONECUT2基因在胃癌中的表达,R软件包进行基因的共聚类微阵列数据分析.(2)利用Kaplan-Meier Plotter数据库和GEPIA数据库分析ONECUT2差异表达与胃癌患者预后的关系.(3)利用生物信息学功能注释数据平台DAVID对胃癌中与ONECUT2基因表达正相关的前200个基因进行功能富集分析.(4)利用GEO数据库中的数据分析H.pylori感染与ONECUT2表达的相关性.结果 (1) Oncomine数据库中的数据在胃癌、膀胱癌等8种肿瘤中共有14项研究显示ONECUT2基因在肿瘤组织中的高表达;其中胃癌相关的有两项(t=6.064,P＜0.000 1;t=4.335,P＜0.000 1);TCGA数据库的数据也证实胃癌中ONECUT2高表达(t=6.680,P＜0.001).(2)胃癌中ONECUT2与EHF、FUT6、TNFRSF11A、RSAEF、EPCAM等20个基因有较高的共表达.(3) GO分析发现胃癌中ONECUT2富集在分子结构活性等相关的基因功能上;而KEGG富集分析发现ONECUT2富集于紧密连接功能等6个通路.(4) Kaplan-Meier Plotter数据库中207676-at芯片结果显示ONECUT2高表达组患者远期生存率下降(P＜0.001);GEPIA数据库中的分析结果同样显示ONECUT2高表达组患者其总体生存率(P＜0.05)和无病生存率(P＜0.01)下降.GEO数据库中GSE74577 (P=0.005)、GSE70394 (P=0.034)和GSE25146 (P=0.036)三个数据集均显示H.pylori感染AGS和GES-1细胞系后ONECUT2表达上调.结论 ONECUT2在胃癌中高表达,且与胃癌一类致癌原H.pylori感染相关.ONECUT2高表达组患者远期生存率下降,表明其与胃癌发生发展密切相关,可能成为胃癌治疗的新靶点.